Každý program to má jinak, proto na low level format použij utilitu od výrobce disku. Dříve to šlo dokonce formátovat v BIOSU, ale dnes už to neplatí.
Nechápu, čeho tím chceš dosáhnout. Pokud disk prodáváš, tak stačí killdisk.
http://www.killdisk.com/downloadfree.htm