obecně ano, tune up pravděpodobně ano - je to jako použití zastaralého pagedefrag ze sysinternals. Nehledě nato, že to je, jak píšeš hromská blbost. Hlavní prací s registry je čtení, málokdy zápis,krom speciálních hodnot nativeAPI, se kterými pracuje natvrdo pouze systém, potřebné hives se načítají do ramky, odkud se s nimi pracuje - s tímhle vším fragmentace místa moc nesouvisí.
Možná bych to přirovnal k defrag. nástroji, co na pozadí defragmentují online soubory a spuštěnému IE co do kešky ukládá dočasné způsobem "na rychlost, ne uspořádaně"- což dělá logicky.