Známý používá Spirit (http://www.spirit3d.cz/uvod.htm). Je to sice především na architekturu, ale jde s tím všechno. Pro studenty je snad i nějaká levná licence.
Neznám ten program, jen jsem mu jej několikrát instaloval a viděl, co v tom dělá.
Jinak na obyčejné znázornění sítě s popisky si myslím stačí Word, nebo OO.