Ne instalace ale instance, jako že spustíš FF několikrát, tak jak ty píšeš "vícenásobné spuštění Firefoxu". Podle mě právě spuštění několik oken je spuštění několik instancí FF. Mám taky v kompu 4 GB RAM, zkusil jsem otevřít 40 "oken" a FF se rapidně zpomalil, v každém okně jsem měl jen jeden panel.

Já mám rovněž zaškrtnuto "Varovat, pokud by otevírání více panelů mohlo zpomalit aplikaci Firefox" a když jsem dal z jedné složky otevřít vše v panelech, tam mi toto varování vyskočilo,takže bych řekl, že to je funkční.

Zkoušel jsi nový profil ? https://support.mozilla.org/cs/kb/Spr%C3%A1va%20pr ofil%C5%AF

Píšeš, že takové problémy si neměl, zkoušel jsi poslední verzi FF ve které ti to v pohodě fungovalo ?