Maven a Eclipse je boj, to je pravda. Ale NetBeans a Idea mají nativní podporu zvládnutou dobře a dá se říct, že funguje bez problémů. Na Eclipse už jsem dávno zanevřel...

U nás používáme Maven (v kombinaci s Nexusem, Jenkinsem a GITem) na všech projektech a dá se říct, že bez problémů. S problémy s autentifikací jsem se nidky nesetkal. Výhodu Mavenu o proti Antu vidím hlavně v docela dobře použitelném dependency managementu.

Gradle je už pak luxus.