Zhodou okolností používam doma kombináciu 20" LCD + 19" CRT na Radeone 9600.
Nerozumiem celkom otázke o prepínaní programov, ale u mňa to funguje asi takto. Doinštaloval som Hydravision zo stránok ATI.com a programy si presúvam myšou z jedného monitora na druhý. Prípadne ešte môžeš kliknúť pravým myšítkom na spustený program v lište a z kontextového menu vybrať položky "Move to monitor 1" resp. 2.

Nejaké záležitosti ohľadne 2 monitorov sa riešili aj tu http://pc.poradna.net/question/view/31821-jak-rozsi rit-spodni-listu-xp-na-2-monitory , ale ja nejaké advanced možnosti nepotebujem, takže viac neporadím.