Když jsem se to pokoušel přepsat, tak mi v souboru zůstal pouze text, kterým jsem chtěl přepsat jenom ten jeden řetězec.

public String ZmenKurzNakup(double castka, int mena) throws IOException
    {
            FileInputStream fstream = new FileInputStream("kurzy.txt");
            DataInputStream vstup = new DataInputStream(fstream);
            BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(vstup));
            String castkas = String.valueOf(castka);
            String strLine = null;
            int i = 0;           
            while(i != mena+1)
            {
                strLine = br.readLine();
                i++;
            }
            String novy = strLine.replaceAll(strLine, castkas);
            
            vstup.close();
            return castkas;