tenhle návod s virtualdubem funguje dobře po jednotlivých souborech, jednou se to nastaví a pak měníš jen zdroj audia a ukládáš do nových souborů
http://www.wikihow.com/Create-a-Youtube-Video-With -an-Image-and-Audio-File-Using-Virtualdub

hromadně by to šlo přes příkazový řádek BATakem, v ffmpegu by řádek vypadal takto, je třeba jen modifikovat názvy vstupních a výstupních souborů (případně vstupních/výstupních adresářů)

ffmpeg -i image.jpg -i audio.mp3 -acodec copy vystupni_video.avi