normální lidi mívají zvlášť systémový oddíl (windows + program files + settings), a zvlášť oddíl pro data.
ta tvoje záloha bez půlky registrů by byla jako dobrá k čemu?

asi všechny klonovací programy umí zálohovat i adresářové struktury. matně se mi vybavuje, že ghost na to měl parametry include/exclude - nepoužívám ho.
ale nač si tím komplikovat život, když může člověk dostat funkční image systémových oddílů, včetně bootsektoru.