Free program ti neporadím, ale zvládne to bez problémů TMPGEnc Plus. File/MPEG Tools/Merge & Cut. Přes Add si do seznamu úloh přidáš MPG soubor a přes edit ho ořízneš po první reklamy. Potvrdíš, přidáš znovu stejný MPG a vyšmikneš další část. Zopakuješ podle počtu částí, pak do kolonky output vepíšeš název nového souboru, ťukneš na Run a on najednou udělá to, že vyšmikne x částí a rovnou je slepí dohromady.

edit: Že ty mě přinutíš udělat dnes podobný objev jako s ImagoMPEG Muxer!