to je omyl, 4096 je velikost alokační jednotky. ta může mít (u zastaralých systémů jako NTFS statickou velikost) třeba 512-65536. Tohle nesouvisí se zarovnáním. Zarovnání znamená, že alokační jednotky by měly právě začínat na násobcích 4096 bytů. Pokud by tomu tak nebylo, pokud OS chce přečíst alokační jednotku(které má náhodou taky 4k), pak by řadič disku musel přečíst 2 sektory, jelikož půlka dat alok. jednotky je na jednom sektoru a půlka na druhym.

PS:
proč mi hdparm ukazuje toto:

Logical  Sector size:                   512 bytes
Physical Sector size:                   4096 bytes