S interní kartou by měla být nižší zátěž systému, přece jen tahat data po PCI(e) je rychlejší než po USB.
Možná plácám kraviny, ale už vzhledem k množství čipů na kartě a velikosti USB síťovky bych tipnul, že u USB krámu bude hodně obstarávat procesor, zatímco PCI karta si to všechno zpracuje sama.