Bože díky ti! Pozval bych tě na
Jinak pro ty, co budou řešit stejný problém, nedejte se zmást. Ve Windows se Latin2 označuje ISO 8859-2, v DOSu je to správně CP852. To znamená, že správné kódování pro konzolové aplikace v Javě je CP852 (v Notepadu++ jako OEM 852)!

Případ vyřešen, moc děkuji!

EDIT: Pro ujasnění - ISO 8859-2 je správně ISO Latin2 kdežto CP852 je správně PC Latin2