Tvoj problem je
1. ze pouzivas program na cisteni registru a nejake optimizery,tunice a ine nicitele. To znamena znefunkcnujes si aktivne a dobrovolne cely Windows.
2. ze si myslis ze ak mas nainstaleny nejaky dementny antivir, tak ze nemas vir. To je ale dost zavazny omyl.

V prvom rade popis co presne mas na mysli tym "nahlym poklesom vykonu", kde, kedy, jak presne sa to prejavuje, co presne sa hybe a co ne.
V druhom rade si pozri spravcu procesov ci pri tom poklese nevytazuje nieco CPU.
V tretom rade si pozri log z hijackthis spusteneho v nudzaku aj normalnom rezime ze co tam vsetko bezi
V stvrtom rade odinstaluj antivi a restart. nejaka zmena v tom znizovani vykonu?
Este by som otestoval cely povrch HDD aspon pomocou HD Tune ale idealne pomocou utility od vyrobcu nabootovanim z UBCD, t.j. ne pod Windows.