apk je archiv, ktery se rozbali do datoveho prostoru na disku (na androidu mas nejcasteji tri logicke disky - system, data, user, snad je z nazvu jasne k cemu jsou). Kdyz aplikaci odinstalujes, smazou se nainstalovane soubory z data, jenze nekdy zustanou zbytky v user, kdyz budes pri odinstalaci postupovat, jak jsem ti napsal omezis tim i zbytky po aplikacich, ktere si po sobe z ruznych duvodu neuklidi nebo to potom z user odmazes sam, do tohohle oddilu muzes libovolne i bez rootu, takze ti nic nebrani (je to ten oddil, kde jsou treba fotky, pokud je nemas nastavene na SD kartu).