U jednoho e-mailu jsem dal školu, označil jako NEspam tento jediný soubor a dal "uč se".
Email někam zmizel, aniž bych ho četl. nemohl se nějak smazat?

Pokud jsi dal NEspam, zmizel samozřejmě ze školy, ale měl by se ti normálně stáhnout do pc do došlé pošty.

Protože jsem to označil jako NEspam, tak by se i při smazání měla adresa nového "přítele" měla objevit v seznamu přátel, ne?

Označit jako NEspam je něco jiného než adresa nového přítele. Nový přítel znamená, že od něj chceš dostat cokoliv, i kdyby to vyhovovalo všem pravidlům spamu. NEspam znamená jen to, že tento email podle tebe není spam - a SI se podle něj učí. Ale další email z téže adresy zase může být označen jako spam.
PS: Mám SI verze 0.9.9.9 - to je IMHO poslední dostupná verze, takže píšu podle ní. Pokud máš jinou verzi, je možné, že máš volby jinak než já.