1) Radí se jako první instalovat Windows (jako více blbější - agresivní, dominantní systém). Není to nutné, dá se pak překlopit/nainstalovat někam jinam (oddíl, disk...), ale pak je práce se zavaděčem (zde GRUB), aby pochopil co má dělat.
2) Jsem staromódní a tuto variantu nepoužívám. Abych zapisoval na NTFS přímo na disk s operačním systémem. Dříve nebyly ovladače pro NTFS tak odladěné (reverzní inženýrství)... řeším to přes speciální oddíl (FAT, nebo truecrypt)
3) Pořadí, způsob zavádění OS řeší zavaděč - GRUB (jednoduchý texťák v adresáři /boot/grub doporu4uji nastudovat pro danou distribuci linuxu.
4] Pro windows existuje podpora přes driver Ext2Fsd (starší, max EXT3), ale funkční
5) Nyní bych doporučil Ubuntu 13.10 nebo si počkat na 14.04 (samozřejmě s upraveným vzhledem, dokem, unity atd..., tak aby se dalo používat)