Nejprve doporučuji prostudovat tohle: http://office.lasakovi.com/word/reference/rejstrik -automaticka-tvorba-word-2010/
Schválně jsem si vyzkoušel v jednom dokumentu označit slova do rejstříku, uložit, ukončit Word (rejstřík jsem nevytvářel) a otevřít dokument znovu. Samozřejmě mi všechna slova zůstala do rejstříku vybraná a klidně jsem mohl nyní přidat další slova a pak rejstřík vytvořit - zahrnulo se do něj vše.
Pokud Ti to nefunguje, lze již vytvořený rejstřík aktualizovat (viz uvedený článek) - nejrychleji asi tak, že najedeš kurzorem na již vytvořený rejstřík a stiskneš klávesu F9.
V článku se také dočteš, jak automaticky zarovnat čísla stránek.
A co se týká přepínání jazyka - opět u mě bez problémů. Alt+Shift+X mi jazyk nemění, pouze Alt+Shift. Ale samozřejmě se dá kombinace kláves pro přepnutí jazyka změnit - viz http://www.windowstipy.cz/clanky/jak-se-prepnout-n a-ceskou-klavesnici/