Windows mají možnost explicitně definovat klávesovou zkratku na přepnutí určité klávesnice
pak stačí toto nadefinovat na všech strojích se čtečkou a v prefixu zadat kód pro přepnutí do ENG, v suffixu zase zpět do CZE.
edit: třetí možnost je použít českou programátorskou klávesnici, nebo českou keymapu vyhodit úplně.