Běh systému zpomalují jen a pouze blbosti, spouštěné automaticky po startu. Ty si hlídej, registry nech na pokoji.
Windows Vista a vyšší už mají automatickou defragmentaci, nemusíš se o nic starat. Navíc - soubory registrů jsou ve srovnání s jinými daty velmi malé a rozhodně nezpůsobují fragmentaci.

Ještě jsi měl otázku na antivir - za sebe doporučuji MS Security Esssential.