není čeho se bát - když máš dva disky můžeš jeden odpojit, tím dosáhneš toho že budeš mít obě windows jako c: - a po připojení prvního disku, ale před! spuštěním windows z něj nabootuješ z instalačky bootmanageru - a po jeho nastavení jsi hepy.
taky bacha ať ti tvoje dvě windows navzájem nepřepisují boot.ini - proto je lepší to oddělení pořádným boot managerem.
na něco podobného ses tu onehdy ptal - platí pro stav kdy ty windows na sebe vidí:
http://pc.poradna.net/question/view/82352-druhy-os- na-jinem-disku a můj odkaz dál. když na sebe nevidí, neobsahuje boot.ini poslední řádek.

win2000 není a nikdy nebude shareware. modrá obrazovka může být způsobena nekompatibilitou příliš nové grafické karty se starými wirdows.

instalace dosového programu - jo, tak by to šlo. v podstatě jakákoli dosová bootovací disketa, nebo servisní bootovací cd, kvůli někdy vhodné podpoře fat32 pro hdd a kompatibilitě s většími disky je lepší disketa z win98. ta originální ale obsahuje fůru balastu. taky ten program může být přidaný rovnou na boot-disketě.