Aha, víc lidí nechápe.

1) přes server: HTTP požadavek z PC 1 (lokální PC či jiný) otevře server. Server a jeho interpreter spustí program (přes exec, systém, fork, ``, atd)

2) lokálně: v chrome kliknu na odkaz typu a href="javascript:ShellOpenFunkce('/opt/geokuk/geok uk.jar')". Spustím se to na tom PC, kde běží ten chrome.