Pokud to bylo jen jednou a ne opakovaně, nemusíš se nijak plašit.
K původnímu dotazu: smazat můžeš úplně vše, co se Ti v tom nástroji nabízí. Na rozdíl od jiných čistících SW nejsou programátoři MS natolik debilní, aby nabídli ke smazání něco, co by Windowsům podřízlo větev.