Smazání složky Prefetch je běžná a z hlediska výkonu nebezpečná pověra. http://mywebpages.comcast.net/SupportCD/XPMyths.htm l (anglicky) - překládat to nebudu.
Závěr: mazání složky Prefetch nikdy neprovádět. Co se týče složky Temp, moderní programy využivají Temp proměnnou ukazující do tvých Documents and settings, takže pokud nepoužíváš nějaké staré programy natvrdo zapisující do WINDOWS\Temp, složka by nikdy neměla mít velkou velikost. (Její obsah je možné obvykle bez následků smazat).
Zkrátka sis přečetl pár běžných internetových pověr.