A ty si myslíš, že složka \Users není uložená na disku?
O kterých 2x uložených datech konkrétně mluvíš?
Zkoušel jsi někdy spustit nástroj "vyčištění disku" i na systémové soubory (tlačítko dole). Tento nástroj je spolehlivý, klidně zaškrtni všechny možnosti. Protože píšeš o Users, předpokládám, že máš Win 7 a vyšší OS.