Tudy cesta (většinou) nevede, musel bys mít EXE soubor, který instalaci provede v "silent" režimu (edit: silent proto, že instalace probíhá ještě před spuštěním Exploreru). Většinu takových instalátorů musíš předělat ručně, nebo poloautomaticky pomocí specializovaných (a patřičně drahých) softů typu Admin Studio, které zároveň obsahuje i InstallShield.
Co se týká instalace SW na kompresi, můžu doporučit 7-zip, který MSI balíček má - nemusíš tedy dělat vůbec nic.