Počítám že se bavíme o 2000/XP. Windows přeberou to nastavení co vidíš při instalaci*. Pokud windows najdou nějaký disk o kterém napíšou že je C tak windows po instalaci na céčku nenajdeš. Také se to týká připojené flash, čtečky paměťových karet (v poslední době módní floppy+čtečka) a pod.

Radši vše navíc odpojuji...

* ve skutečnosti zřejmě windows přebírají písmenka disků po prvním restartu -takže zapomenutou flashku či čtečku máš ještě šanci před tím restartem odpojit.