Ve Správci úloh to musí být taky. Máš zobrazené procesy všech uživatelů?
Problém není v Javě jako takové, ale v nějakém programu v Javě napsaném. Pokud si ve Správci úloh zobrazíš i příkazovou řádku, s jakou byl ten proces spuštěn, tak zjistíš, co se ti to spouští.