Třeba nestíhá tvoje připojení nebo grafická karta.
Na YouTube můžeš zaexperimentovat s vypnutím HW akcelerace (v prohlížeči i na videu ve stránce - PTM - Nastavení...), anebo se přepnout do HTML5 (https://www.youtube.com/html5).
Chrome a Firefox by měly umět YouTube video i bez flash pluginů.