No, není to nic tak kritického. Sám mám na notebooku dualboot takovým způsobem, že můžu spustit ten "neaktivní" systém jako virutální v tom fyzicky běžícím. Akorát jsem vnutil virtualboxu jiný MBR (prvních 512B je samostatný soubor), aby mi to nepřepsalo partition tabulku fyzického disku.