skoro.
(předpokládám inteligentní uložení všech dat na d:, na c: jsou jen programy a systém)
jestli zálohuješ systémový oddíl, uložíš si současně s ním i ten 100mb boot-oddíl. při obnově ho budeš potřebovat.
dobře si s tím poradí třeba true image.

ale pokud instaluješ windows znovu, už máš kdesi dál na disku své déčko s daty, c: jsi zrušil a je tam jen volné místo, pak se při nové instalaci samostatný 100mb oddíl nevytvoří, bude jen adresář \boot na systémovém disku.