Nevim, jestli je to pricina problemu, ale ja jsem zvykly instalovat svoje knihovny do
/usr/lib/python2.7/site-packages/cosi/neco.py (v ramci baliku neco, samozrejme tam mam i __init__.py)
eventualne samostatne do
/usr/lib/python2.7/site-packages/neco.py
a chodi mi to bez problemu.