OMG a v com presne mas problem? Chces z toho disku bootovat alebo co ti nejde? Ak nepotrebujes z toho disku bootovat tak nepotrebujes nic robit s BIOSom. Velkost BIOSu bude vzdy stejna (=velkosti flash), a v novej verzii su zmeny vzdy, inac by nebola nova verzia. Flashovat BIOS nie je nutne ak nema clovek ziaden problem, ale ak si si isty ze presne pre tvoju dosku (typ+verzia) existuje novsi BIOS naflashoval by som (neriesi to ale tvoj problem, ptz ziaden problem nemas resp. ziaden problem som v tvojej otazke nenasiel).
Potrebujes si vytvorit/naformatovat particiu taku, aby ju videl Win98, t.j. FAT32, nie som si isty ci nahodou Win9x nevedia len particie max 128MB t.j. tych particii tam bude viac. Ak si to naformatoval na NTFS tak je logicke ze Win98 tu particiu nevidia.