Hibernate nema nic spolecneho s HTML strankama. Hibernate je jedna z implementaci JPA (Java Persistence Api) a jedna se o framework na objektove-relacni mapovani na databazove vrstve.

Pokud chces naprogramovat webovou aplikaci v jave, ktera pouziva hibernate, mas spousty moznosti, jak to udelat. Ja mam treba nejradeji kombinaci:

Server (Spring MVC, Hibernate)
- REST controllery vracejici JSON jako data pro HMTL stranky
- REST api na manipulaci s daty
- na DAO vrstvu pouzijes prave Hibernate, bude se ti zjednodusene receno starat o mapovani domain objektu na tabulky v DB - integrace Springu a Hibernate je fajn, da se vygooglit spousty navodu...

Na klientu HTML, CSS a Javascript. Nemusi to byt cisty javascript, muzes pouzit nejaky framework jako Angular, jQuery, backbone, extJs a milion dalsich.

Vyhoda tohoto reseni (se Springem) je, ze nepotrebujes aplikacni server. Pouzijes spring boot a aplikaci prelozis do jar souboru a spustis na libovolnem stroji s JRE.