Pokud jsi to bezmyšlenkovitě odklikal, pak se provádí upgrade se zachováním souborů a aplikací a s největší pravděpodobností začnou problémy. Pokud ne hned, tak za pár dnů nebo máš obrovské štěstí.
Pokud štěstí nemáš, pak postup s ISO a čistou instalací je na místě.

Update "odloží" původní systém do adresáře Windows.Old (týká se systémových adresářů jako Windows, Program files, APPData, ...).
Vše ostatní na disku nechá, takže i tvé vlastní složky, které jsi na disku měl.