Program sa dá chrániť heslom - potom ho bez hesla nespustíš ...
Napr: http://www.eltima.com/products/screenshots/exe-pass word/
Pomôže Ti Google 
Ale ako chceš
aby nikto iný okrem mňa by ho nemohol otvoriť aj keď je spustený
Raz keď je spustený tak, čo máš na mysli nemohol otvoriť ?