Problém v tom nevidím.

Čím více bude RAMky a čím větší bude CF, tím líp.
Přepisy (registrů) na CF bych asi nesledoval

Úplně nejlepší by bylo nabootovat celé Windowsy z CF/C: přímo do RAM (ramdisk E:) (live XP) a data ukládat na CF/D: A případné další programy kopírovat (tvým způsobem) na další ramdisk F:. Na ramdisku by měl být i nějaký malý swap, některé aplikace jej prostě chtějí.

Ale to by bylo IMHO potřeba ještě více RAMky, aspoň o giga.