Každý operační systém, do kterého něco nahráváš, popř. s ním chodíš na internet by měl mít svůj antivir.
Když spustíš jeden ze systémů, apustí se ti pouze programy, které jsi do něj nainstaloval.
Pokud v jednom OS antivir nainstalovaný bude a v druhém ne, bude chráněn pouze jeden OS.