Pedrosso má pravdu.

Osobně bych volil tak že pokuď bych chtěl mít jen Win na C: tak bych měl ale SSD disk

Jinak v dnešní době je nejlepší pokud máš klasický HDD jako já:

C: - Win + SW
D: - Data, Záloha, Filmy, Hudba, apod. (prostě věci které se neinstalují)
E: - Obnova (abych furt nemusel tahat CD s OS, tak jsem si ho hodil do .iso a vymezil si oddíl 4GB a když instaluju nové Win, tak bootuju z HDD, z 2TB mě 4GB nezabijou :D )

A nechápu proč tu furt točíš o rozdělení HDD ?
OS to bere takže jeden oddíl je Systémový (C:) a zbytek jsou ostatní oddíly. Mu je jedno jestli si programy instaluješ do C nebo do D/E/F. Jen některé programy požadují být na stejném oddílu jako je OS, tuším že např. Dx, ovladače, knihovny, apod. (Většinou takový ty které jsou nutné pro chod OS a SW)