na usb klíč se nikdy nic žádným vypalovacím programem nevypaluje, to si zásadně pleteš dojmy.

zvysnych 10gb na kluci zostane zablokovanych kde sa neda zapisovat nic

spíš půjde o jiný případ: formátovací program pro flashku udělá oddíl 5.5gb.
zbylé místo může linux úmyslně používat jako další oddíl s vlastním formátem, na který windows nezapíše.
druhým důvodem je to, že windows nepodporuje více oddílů na usb discích a přečtou jen první z nich.

byl by potřeba screen flashky z inteligentního partition manageru, ať je jasné, o co jde.