flashka je nespolehlivé médium a drahé. když už tak si zálohu ulož na druhý disk.
je taková zásada: samotný systém uložit do image souboru. ty softy to umí obnovit tak, že je ten disk funkční = bootovací. k jednotlivým souborům obvykle není potřeba přistupovat, i když to bývá možné.
uživatelská data: je lepší mít disk rozdělený a data dávat na druhý oddíl, ať se nesmyslně necpou do zálohy systému. také je potřeba k jednotlivým souborům přistupovat, proto se zálohují prostým kopírováním (kvůli změnám lze modifikovat název podle data).

shadow storage: nevím proč trváš na této metodě. vss využívá k zálohování za chodu placený drive snapshot.
nebo bitová kopie windows, ale těm ms paskvilům s neustále jinými názvy nevěřím a vyhýbám se jim.
windows backup dělá zálohu 1:1 a netuším, jestli je to bootovací, okamžitě jsem to zavrhnul.
drive snapshot komprimuje systém a aplikace zhruba na polovinu, jako všechny normální imagovací sw.

samozřejmě když dostaneš blbý nápad ukládat do image filmy nebo fotky, které už komprimované jsou, kromě ztráty času to nezmenšíš vůbec.