Znám dva ryze free softy - jedno je zmíněné freeOCR, druhé Gocr (to je pro linux, zda i pro wokna nevím). Ani jedno si si diakritikou neumí moc poradit i když Gocr se prý umí učit.
Abbyy je zatím to nejlepší, co jsem v této oblasti měl možnost zkusit, jinak třeba HP dává ke skenerům OCR Readiris, které taky není úplně nejhorší a jeho plná verze byla kdysi na nějakém cd Pcworldu nebo Chipu (bezplatná registrace). Ovládání bylo anglické, ale mělo podporu češtiny, leze z toho myslím doc nebo pdf.