MT necachuje skoro nic - nemá na to ani disk, ani paměť.

ale vyloučit z cachování můžeš pomocí /ip proxy cache deny

viz http://wiki.mikrotik.com/wiki/Manual:IP/Proxy

edit: pokud chceš cache obejít úplně (třeba z důvodu, že pak stránky nefungují), musíš to udělat na úrovni firewallu, kde před pravidlem přesměrovávajícím traffic webu do cache musíš přidat pravidlo, které toto přesměrování obejde.