Výborně napsaný dotaz a popis problému. To se jen tak nevidí.
Tím příkazem nehledáš vadné sektory.Mimo jiné jsem spustila příkaz chkdsk - nenašel žádný vadný sektor
Je dost možné, že disk čte soubory na "více pokusů", proto vyzkoušej http://www.hdtune.com/files/hdtunepro_560_trial.ex e , podívej se na záložku health a taky proskenuj povrch disku. To je v záložce "error scan"