To chápeš špatně. Clone je kopie repository stažená na lokální počítač, ale rozhodně není samostatná. Fork je kopie repository v rámci GitHubu. Zatímco klonování je obecná záležitost Gitu (a podobných VCS např. Mercurialu), fork je už specialita GitHubu (a nejspíš i dalších podobných úložišť).