Vyzkoušel bych tento postup:

1) zastavit službu automatických aktualizací
2) přejmenovat adresář SoftwareDistribution a soubor WindowsUpdate.log (nebo smazat)
3) znova nainstalovat Agenta 3.0 s parametrem /wuforce
4) zkontrolovat jestli se spustila služba, případně ji spustit ručně

Pro urychlení se ještě může použít wuauclt /detectnow, ale to až pár minut po spuštění služby a když v logu není vidět, že by služba již něco dělala.

Po tomto postupu by si agent měl znova prověřit počítač a podle toho vytvořit seznam pro stažení aktualizací z MS. Pokud ani po tomto nebudou automatické aktualizace fungovat, tak dej někam WindowsUpdate.log.

Logy jsou tu důležité dva:
C:\WINDOWS\WindowsUpdate.log
C:\WINDOWS\Softw areDistribution\ReportingEvents.log