mám pocit že pokud nemáš v cestě žádný router, nemusíš nic s portama řešit, protože probouzíš jen spící board s biosem, nic jiného v té době nefunguje.
já si tím běžně zapínám pc v sousední konferenčce, jinak zkoušeno na více pc (připojených k jednomu racku s nějakým síťovým prvky).
schválně jem teď vlezl na halu, ať jsu na jiném segmentu sítě, ale volný krám se kterým jsem si hrál je nějaký divný, a protější konferenčkový krám mi mezitím zapli :(

gui používám tuto utilitku http://www.depicus.com/wake-on-lan/wake-on-lan-gui. aspx (podle výpisu z arp se s nějakým switchem v cestě nepárá), ale má tam více verzí, můžeš laborovat.