ty Win disky byly asi FAT32, že? (Jinak si nedokážu představit, proč by se NTFS měl poškodit, když se s ním nic nedělalo)

V takových případech se používají nástroje pro obnovu poškozených oddílů FAT, osobně mám dobré zkušenosti se SW GetDataBack od Runtime Software.

Rozhodně bych doporučil převod všech Win oddílů na NTFS (žádný PQ Magic, ale jedině příkazem Convert z Windows, pokud jsou ti tvá data milá), pokud tvá Linuxová distribuce nepodporuje NTFS, nech si nějaký menší "přenosový" oddíl, ale nepočítej s velkou spolehlivostí takového oddílu.

P.S.: FAT32 je dneska pro použití na pevných discích už definitivní mrtvola.