mám pocit že jsi ale nezvážil jednu věc:
jestli tě naneštěstí napadlo použít šifrování pro tebe důležitých složek (třeba čtenáři různých jnp to rádi dělají), pak po nové instalaci se budeš docela divit že se k zašifrovaným souborům už nedostaneš.

asi tak: do c:\documents&settings patří jen osobní nastavení, ale žádné dokumenty a data tam nemají co dělat.
doporučuju xp systém nainstalovat na 10-20gb c:, veškerá data patří na d:
když se "samy" znefunkční windows, prostě jen smažeš c: a tvoje cenná data na d: zůstávají - opět s výjimkou těch zašifovaných - jejich klíč samozřejmě zmizel se zformátováním c:

edit: právě na jednorázovou zálohu nainstalovaného systému (windows, program files) včetně registrů se používají ty "imagovací" programy. proto taky uživatelská data na tomto systémovém disku nemají co dělat.
ale tímto postupem se vytvoří přesná záloha pro obnovení celého minulého stavu windows, není vždy možné odsud vzít jen adresář s nainstalovaným programem a dokopírovat ho do nových windows, k tomu skutečně slouží originální instalačky sw.
naopak uživatelská data stačí průběžně "zálohovat" i total commanderem, prakticky se to raději řeší naplánovanými úlohami pomocí programů, které zipují plné/přírůstkové zálohy podle data.