tak jednoduché jak to vidí kolega m. to nebude, to asi tušíš sám.

je dobře že chceš vyprat datový disk na nějakou další sata pozici, ať se neplete do číslování disků při bootování. úplně nejlepší pokud to jde, je když má datový disk čistě jen extended oddíl, není na něm primary partition. pokud ho potřebuješ někam přenést, nebude se cpát jinde mezi písmena systémových disků. nainstalovaná windows po startu projdou připojené disky, a pokud nebylo ručně změněno jinak, přiřadí jim písmena v pořadí: disk/na něm první primární oddíl, další disky, pak další primární oddíly.
bohužel stejný nápad můžou windows dostat i při instalaci, kdy budeš chtít bootovat ze svého sata, nezávisle na starém disku ide (jestli v pc je nebo není, jestli se tím změní pořadí disků. proto taky datový disk odsouváš na poslední kanál řadiče, to je správné pro všechny případy)

a) nejspolehlivější pro nezávislou instalaci windows, bez ohledu na jakési pořadí disků, je pokud se sata řadič detekuje jako zvláštní zařízení (určitě to dělají přídavné řadiče raid na desce mimo klasický southbridge). takový řadič bude mít v boot.ini číslovanou vlastní skupinu disků bez ohledu na ide řadič.

b) naopak pokud se díky nastavení v biosu (sata jako emulace ide) nainstaluje sata disk až jako n-tý běžný disk v pořadí za ide, tzn. v boot.ini bude záznam rdisk(n), pak bych se skoro bál ten ide disk vytáhnout ať ještě z nového systému nabootuju. možná by pro ten případ pomohlo doplnit alternativní záznam v boot.ini:
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDO WS="XP na SATA disku, bez IDE" /fastdetect ...

no a jak dopadne případ instalace kdy v biosu bude volba "native sata" a xp budou chtít při instalaci disketu s ovladači sata řadiče, ví jen levá noha microsoftova - ale každopádně to bude jeden ze dvou předchozích případů :)

samozřejmě přitom předpokládám pořadí bootování přednastavené v biosu už na konkrétní disk, ať si ještě navzájem nepřepisují právě svoje boot.ini.

čili windows xp nemusí startovat jen z master řadiče. a ani ne nutně z primary oddílu.

drobné riziko tu je: v případě b) se může stát, že windows při startu/instalaci vidí ide disk s nižším pořadovým číslem, a vidí na něm primary oddíl. potom pravá smradlavá noha microsoftova nedostane lepší nápad než místo instalace na C: ti tu sata instalačku opísmenkuje třeba jako F:
(nebo tam zatím žádný není ale jednou ho tam před svoje sata C: přidáš)
dá se s tím žít, funguje to, ale jen do té doby než vytáhneš z pc ten ide disk (nebo mu na jiný sata kanál nevrazíš disk kterému dá řadič nižší číslo). pak se může stát že windows při startu zareaguje s genialitou sobě vlastní, přepísmenkuje si systém, a v postatě jsi skončil - ty windows jsou prakticky mrtvé.